承担了大量国家下达和地方委托的各项水环境监测任务以及社会各界委托的样品检测任务，包括流域水质资料整理汇编，流域省界水体水环境质量通报和水资源质量年报。

水环境监测

珠江口八大口门水环境常规监测；

珠江流域省界水体水环境质量监测；

广州抽水蓄能电站水质监测；

西江下游供水水源地监测；

珠江三角洲丰、枯水期同步水质水量监测；

深圳湾水质水量同步监测；

磨刀门水域水质水量同步监测；

珠江流域重要排污口监测。

水生态监测

高原湖泊水生态监测；

省界试点水库水生态监测；

磨刀门水道水生态监测；

百色水利枢纽水生态监测；

广州抽水蓄能电厂水生态监测；

惠州抽水蓄能电厂水生态监测；

淡水和咸淡水水体水生生物调查。